3 ECTS credits
75 u studietijd

Aanbieding 1 met studiegidsnummer 4009214ENR voor alle studenten in het 2e semester met een verdiepend master niveau.

Semester
2e semester
Inschrijving onder examencontract
Niet mogelijk
Beoordelingsvoet
Beoordeling (0 tot 20)
2e zittijd mogelijk
Ja
Onderwijstaal
Engels
Faculteit
Faculteit Wetenschappen en Bio-ingenieurswetensch.
Verantwoordelijke vakgroep
Biologie
Onderwijsteam
Marc Kochzius (titularis)
Onderdelen en contacturen
20 contacturen Hoorcollege
13 contacturen Werkvormen en Praktische Oef.
Inhoud

This course gives a brief introduction to molecular methods used in ecology and conservation genetics at population level:

  • Genetics, genomics and conservation
  • Genetic variation in natural populations
  • Population genomics
  • Random mating populations: Hardy-Weinberg principle
  • Small populations and genetic drift
  • Effective population size
  • Population subdivision and gene flow

 

Practical exercises comprise data analysis of DNA sequence and microsatellite DNA using various freely available softwares, such as MEGA, Arlequin, GENALEX and STRUCTURE.

 

Course material:

Handbook (Recommended): Allendorf FW, Funk WC, Aitken SN, Byrne M, Luikart G (2022) Conservation and the Genomics of Populations.

Digital course material (recommended): Scientific papers on conservation genetics and molecular ecology. One paper on the molecular ecology of a species has to be chosen to present in the oral examen.

Studiemateriaal
Handboek (Aanbevolen) : Conservation and the Genomics of Populations, Allendorf FW, Funk WC, Aitken SN, Byrne M, Luikart G, 4e, Oxford University Press, 9780198856573, 2023
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Lecture slides, Kochzius, M., Available at Canvas
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Scientific papers on conservation genetics and molecular ecology. One paper on the molecular ecology of a species has to be chosen to present in the oral examen., E-library of VUB
Bijkomende info

Students who do not have a background in molecular ecology (genetic methods, DNA barcoding, phylogenetics, phylogeography and population genetics) should study this with the help of the following textbook before the start of the course: Freeland JR (2020) Molecular Ecology, 3rd edition, Wiley Blackwell, ISBN: 978-1-119-42615-8

Leerresultaten

Algemene competenties

The overall objective of the course is to introduce the students in the genetics of biodiversity (as opposed to species and ecosystem diversity). Therefore, basic knowledge about DNA, genes and genomes is essential (see above and read Freeland, 2020). This course will place emphasis on ecological and conservation genetics of marine species.

Beoordelingsinformatie

De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 70% van het eindcijfer

WPO Verslag bepaalt 30% van het eindcijfer

Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:

  • Oral examination met een wegingsfactor 1 en aldus 70% van het totale eindcijfer.

Binnen de categorie WPO Verslag dient men volgende opdrachten af te werken:

  • Reports met een wegingsfactor 1 en aldus 30% van het totale eindcijfer.

Aanvullende info mbt evaluatie

The final grade is composed based on the following categories:

  • Oral Exam determines 70% of the final mark.
  • Practical Reports determines 30% of the final mark.

 

 

Toegestane onvoldoende
Kijk in het aanvullend OER van je faculteit na of een toegestane onvoldoende mogelijk is voor dit opleidingsonderdeel.

Academische context

Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Master in de biologie: ecologie en biodiversiteit
Master in de biologie: onderwijs
Master of Marine and Lacustrine Science and Management: Standaard traject (enkel aangeboden in het Engels)
Master of Biology: Ecology and Biodiversity (enkel aangeboden in het Engels)
Educatieve master in de wetenschappen en technologie: biologie (120 ECTS, Etterbeek)