6 ECTS credits
168 u studietijd
Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1009837BNR voor alle studenten in het 1e semester met een verdiepend bachelor niveau.
Eiwitten kunnen worden beschouwd als de effectormoleculen die verantwoordelijk zijn voor de meeste cellulaire processen. De aanwezigheid en activiteiten van eiwitten kunnen op verschillende niveau’s worden gereguleerd. Een belangrijk mechanisme voor de regulatie van eiwitexpressie is transcriptionele regulatie; dit proces is in belangrijke mate verantwoordelijk voor differentiële expressie van eiwitten in verschillende celtypes en in de tijd.
In het eerste deel van dit opleidingsonderdeel zullen methodes voor de analyse van genexpressie in cellen worden behandeld, in samenhang met toepassingen in biomedisch onderzoek. Dit betreft zowel expressie op mRNA als op eiwit niveau.
Het grootste deel van dit opleidingsonderdeel betreft eiwitonderzoek in het algemeen, waarbij de volgende aspecten aan bod komen: eiwitdetectie, eiwitzuivering, eiwitidentificatie, post-translationele modificaties, eiwit-eiwit interacties, eiwit-translocatie en –secretie. Moderne technieken die eiwitonderzoek op grote schaal mogelijk maken (proteomics) zullen uitgebreid aan bod komen.
Het doel van dit onderdeel is drieledig:
1. Behandeling van een aantal belangrijke theoretische aspecten van cellulaire eiwitten die nog niet eerder in het curriculum aan bod zijn gekomen
2. Introductie van moderne eiwittechnieken (waaronder proteomics)
3. De student inzicht geven in hoe eiwitonderzoek kan bijdragen aan het vergaren van fundamentele kennis (genfunctie), inzicht in het ontstaan van ziektes, het stellen van diagnoses en de behandeling van ziektes.
Het practicum bouwt voort op de in deel I geleerde vaardigheden voor het kweken van zoogdiercellen en sluit aan bij de theorie van deel II. In vitro gekweekte cellen worden getransfecteerd met een eukaryotische expressievector coderend voor een humaan eiwit. Zowel de cellulaire expressie van mRNA en eiwit als de secretie van het eiwit zullen worden onderzocht. The resultaten zullen worden gepresenteerd in een kort wetenschappelijk verslag in de format van een wetenschappelijk artikel.
De te bestuderen stof bestaan uit notities genomen tijdens de lessen, Powerpointpresentaties (on-line), tijdens de lessen opgegeven wetenschappelijke publicaties en hoofdstukken uit Molecular Cell Biology (Lodish), en een syllabus die dient als handleiding voor gebruik en integratie van het studiemateriaal.
Aanvullend studiemateriaal:
Overige hoofdstukken uit Molecular Cell Biology (Lodish) als achtergrond informatie
De bachelor BMWkent
· de disciplines uit het biomedische domein met aandacht voor hun ontwikkeling
· de structuur en functie van cellen, weefsels, organen en het menselijk lichaam als geheel en de moleculaire processen die aan de basis liggen, in gezonde omstandigheden
· de structuur en functie van cellen, weefsels, organen en het menselijk lichaam als geheel en de moleculaire processen die aan de basis liggen, in ziekteomstandigheden
· de basistechnieken en -methodologie van het biomedisch onderzoek met aandacht voor hun ontwikkeling
· de beginselen van het werken met proefdieren met voortdurende aandacht voor het ethische aspect
· de principes van veilig werken in een wetenschappelijk laboratorium
De bachelor BMWkan
· analytisch en probleemoplossend denken
· binnen een team functioneren en constructief bijdragen tot het bereiken van het beoogde eindresultaat.
· vlot en kritisch Engelstalige wetenschappelijke literatuur en relevante databases raadplegen, en daaruit gegevens verzamelen en interpreteren
· gebruikelijke biomedische laboratoriumtechnieken zelfstandig, correct en veilig uitvoeren
· duidelijk communiceren en rapporteren over eigen en teamresultaten en over literatuurstudies en dit zowel mondeling als schriftelijk
· het biomedisch onderzoek plaatsen in een ruime maatschappelijke context met oog voor ethische, sociale en economische aspecten
De bachelor BMWheeft
· een voortdurende open en kritische houding tegenover zichzelf en de wetenschappelijke omgeving
· oog voor het belang van internationale samenwerking binnen het biomedische domein.
· een houding van levenslang leren verworven en houdt zich dan ook op de hoogte van de nieuwste ontwikkelingen in het domein van de wetenschappen in het algemeen en het biomedisch domein in het bijzonder
Het kunnen uitvoeren van de volgende technieken:
Celkweek, opkweken en isolatie van plasmides, isolatie van mRNA, RT-PCR, transfectie van eukaryotische cellen, immunohistochemie, immunoblotting, Enzyme Immunometric Assays, agarose gelelectroforese.
De resultaten kunnen interpreteren.
De resultaten kunnen presenteren in een wetenschappelijk verslag.
De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 80% van het eindcijfer
WPO Praktijkopdracht bepaalt 20% van het eindcijfer
Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:
Binnen de categorie WPO Praktijkopdracht dient men volgende opdrachten af te werken:
Het examen over de HOC’s is mondeling. Er zal worden getest op kennis van en inzicht in onderzoeksmethoden en technieken in de biomedische research. Studenten moeten in staat te zijn om deze methoden met elkaar te vergelijken. Ook zullen de studenten inzicht moeten hebben in hoe de toe te passen methode afhangt van de vraagstelling en het gebruikte biologisch materiaal, en hoe men de verkregen resultaten kan interpreteren in de context van een vraagstelling.
De prestaties in het practicum worden beoordeeld op basis van inzet, praktische vaardigheden en verslaggeving.
De punten voor het mondeling examen en het practicum worden als volgt gewogen: 80% mondeling examen, 20% practicum. Als er minder dan een 8/20 voor het WPO wordt behaald zal het eindtotaal maximaal 9/20 bedragen.
Alleen voor het mondeling examen HOC is een tweede zit mogelijk. Zowel voor het mondeling examen als voor de WPO praktijkopdracht wordt een deelvrijstelling gegeven bij een score van minstens 10/20. Deze vrijstelling geldt voor de tweede zit en de volgende academiejaren.
Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Bachelor in de biomedische wetenschappen: Standaard traject
Bachelor in de biomedische wetenschappen: Verkort traject