6 ECTS credits
168 u studietijd

Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1009837BNR voor alle studenten in het 1e semester met een verdiepend bachelor niveau.

Semester
1e semester
Inschrijving onder examencontract
Niet mogelijk
Beoordelingsvoet
Beoordeling (0 tot 20)
2e zittijd mogelijk
Ja
Inschrijvingsvereisten
Omwille van specifieke risico’s en veiligheidsredenen, moet je geslaagd zijn voor ‘Experimentele cellulaire en moleculaire biologie I’ alvorens dit opleidingsonderdeel te kunnen opnemen.
Onderwijstaal
Nederlands
Faculteit
Faculteit Geneeskunde en Farmacie
Verantwoordelijke vakgroep
Basis (bio-) medische wetenschappen
Onderwijsteam
Karin Vanderkerken
Elke De Bruyne (titularis)
Hatice Satilmis
Arne Van der Vreken
Onderdelen en contacturen
36 contacturen Hoorcollege
32 contacturen Werkcolleges, practica en oefeningen
Inhoud

Eiwitten kunnen worden beschouwd als de effectormoleculen die verantwoordelijk zijn voor de meeste cellulaire processen. De aanwezigheid en activiteit van eiwitten kunnen op verschillende niveau’s worden gereguleerd. Een belangrijk mechanisme voor de regulatie van eiwitexpressie is transcriptionele regulatie; dit proces is in belangrijke mate verantwoordelijk voor de differentiële expressie van eiwitten in verschillende celtypes en in functie van de tijd. In deze cursus zal er echter voornamelijk worden ingegaan op de post-translationele processen die de eiwitconcentraties in de cel bepalen, waaronder de regulatie van mRNA afbraak, translatie en stabiliteit. In het eerste deel van dit opleidingsonderdeel zullen methodes voor de analyse van genexpressie in cellen worden behandeld en dit in nauwe samenhang met toepassingen in het biomedisch onderzoek. Dit betreft zowel expressie op mRNA niveau als op eiwit niveau. Het tweede en grootste deel van het opleidingsonderdeel betreft eiwitonderzoek in het algemeen, waarbij de volgende aspecten aan bod komen: eiwitdetectie, eiwitzuivering, eiwitidentificatie, post-translationele modificaties, eiwit-eiwit interacties, eiwit-translocatie en eiwitsecretie. Moderne technieken die eiwitonderzoek op grote schaal mogelijk maken (proteomics) zullen ook aan bod komen.

Het doel van dit opleidingsonderdeel is drieledig:

  • Behandeling van een aantal belangrijke theoretische aspecten van eiwitten die nog niet eerder in het curriculum aan bod zijn gekomen.
  • Introductie van moderne eiwittechnieken (waaronder ook proteomics).
  • De student inzicht geven in hoe eiwitonderzoek kan bijdragen tot 1) het vergaren van fundamentele kennis naar de genfunctie, 2) het verkrijgen van fundamenteel inzicht in het ontstaan van ziektes en 3) het stellen van diagnoses en/of de behandeling van ziektes.

De practica en werkcolleges (WPOs) bouwen voort op de in ECMBI reeds aangeleerde vaardigheden voor het kweken van zoogdiercellen en sluit aan bij de theorie van ECMBII. In vitro gekweekte cellen zullen worden getransfecteerd met een eukaryotische expressievector coderend voor een humaan eiwit. De cellulaire expressie van zowel het mRNA als eiwit en de secretie van het eiwit zullen worden onderzocht. De resultaten zullen worden gerapporteerd in de vorm van een mondelinge uiteenzetting (powerpoint presentatie).

Studiemateriaal
Praktisch cursusmateriaal (Vereist) : Wetenschappelijke publicaties, Canvas
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Powerpoint presentaties (slides), Elke De Bruyne, Canvas
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Cursustekst Experimentele cellulaire en moleculaire biologie II, Syllabus die als leidraad dient gebruikt te worden en dient aangevuld te worden met de lesnota's & slides, Elke De Bruyne, Canvas
Handboek (Aanbevolen) : Molecular Cell Biology, Lodish, 9de, Palgrave Macmillan, 9781319365486, 2021
Cursustekst (Vereist) : Practicum handleiding, Protocols die gevolgd dienen te worden tijdens de practica., Wordt beschikbaar gesteld aan de studenten bij de start van de WPO reeks
Bijkomende info

Deelname aan de hierboven beschreven practica en werkcolleges (WPOs) is verplicht. Deze verplichte deelname zal leiden tot het bereiken van de vooropgestelde leerdoelen. Afwezigheid is alleen gewettigd mits doktersattest. Bij ongewettigde afwezigheid krijgt de student een 0/20 voor het betreffende practicum/werkcollege (inclusief de daaraan gekoppelde testen en oefeningen ). Er zijn geen inhaalmomenten mogelijk voor de gemiste WPOs, ongeacht of de afwezigheid gewettigd was of niet. Een student die slechts 70% of minder van de WPOs effectief heeft uitgevoerd/deelgenomen, ongeacht of de afwezigheden gewettigd waren of niet, krijgt als eindcijfer voor het examen 'Afwezig', en kan dus niet slagen voor ECMB2.

Voor meer informatie omtrent de concrete inrichting van het opleidingsonderdeel: zie Canvas.

Leerresultaten

Algemene competenties

De Opleidingsonderdeel specifieke leerresultaten zijn de volgende:

De student kent/weet:

  • De complexe regulerende mechanismen betrokken in eiwit expressie, activiteit, transport, eiwit-eiwit interacties en eiwitsecretie
  • De verschillende methodes die de analyse van genexpressie (zowel op mRNA als eiwit niveau) in cellen toelaat, met aandacht voor nieuwe technologische ontwikkelingen.
  • De verschillende methodes die eiwitonderzoek in de brede zin van het woord toelaat, met aandacht voor nieuwe technologische ontwikkelingen.
  • Hoe eiwitonderzoek bijdraagt tot de verschillende aspecten binnen het Biomedische onderzoek, waaronder fundamenteel onderzoek naar de gen functie, de etiologie van ziektes en de diagnose en behandeling van ziekte

De student kan:

  • De principes van de wetenschappelijke methode toepassen.
  • De verschillende moleculaire methodes kritisch met elkaar vergelijken en de voor- en nadelen van elke methode formuleren.
  • De verschillende moleculaire methodes integreren vertrekkende van een wetenschappelijke vraagstelling.
  • Vlot en kritisch Engelstalige wetenschappelijke literatuur raadplegen, en daaruit gegevens verzamelen, interpreteren en beoordelen.
  • Gebruikelijke moleculaire laboratoriumtechnieken, waaronder opkweken en isolatie van plasmide DNA, transfectie van eukaryote cellen, isolatie van mRNA, RT-PCR, agarose gelelektroforese, immunohistochemie, immunoblotting en ELISA, zelfstandig, correct en veilig uitvoeren.
  • De eigen/teamresultaten interpreteren en hier duidelijk over communiceren/rapporteren en dit zowel mondeling als schriftelijk.

Beoordelingsinformatie

De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 80% van het eindcijfer

WPO Praktijkopdracht bepaalt 20% van het eindcijfer

Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:

  • Mondeling examen met een wegingsfactor 80 en aldus 80% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Het examen over de HOC’s is mondeling. Er zal worden getest op kennis van en inzicht in onderzoeksmethoden en technieken in het Biomedische onderzoek. Studenten moeten in staat te zijn om deze methoden met elkaar te vergelijken. Ook zullen de studenten inzicht moeten hebben in hoe de toe te passen methode afhangt van de vraagstelling en het gebruikte biologisch materiaal, en hoe men de verkregen resultaten kan interpreteren in de context van een vraagstelling.

Binnen de categorie WPO Praktijkopdracht dient men volgende opdrachten af te werken:

  • WPO verslaggeving met een wegingsfactor 10 en aldus 10% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Beoordeling op basis van verslaggeving van de practica.
  • WPO testen met een wegingsfactor 6 en aldus 6% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Beoordeling op basis van onaangekondigde testen.
  • WPO inzet & oefeningen met een wegingsfactor 4 en aldus 4% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Beoordeling op basis van inzet, labo-attitude, groepswerk, praktische vaardigheden en oefeningen.

Aanvullende info mbt evaluatie

Het examen is mondeling. Er zal worden getest op kennis van en inzicht in onderzoeksmethoden en technieken in het Biomedische onderzoek. Studenten moeten ook in staat te zijn om deze methoden met elkaar te vergelijken en inzicht hebben in hoe de toe te passen methode afhangt van de vraagstelling en het gebruikte biologisch materiaal, en hoe men de verkregen resultaten kan interpreteren in de context van een vraagstelling.

De prestaties in de WPOs worden tijdens het academiejaar beoordeeld op basis van inzet, labo-attitude, groepswerk, praktische vaardigheden, verslaggeving, oefeningen en onaangekondigde testen. De uiterste datum van indienen van de opdrachten ter verslaggeving wordt medegedeeld tijdens de practica en/of via Canvas. Het laattijdig of niet indienen van de opdracht zal resulteren in een score van 0/20 voor de desbetreffende opdracht. Het is niet mogelijk te herkansen voor het WPO.

De punten voor het mondeling examen en praktijk examen worden als volgt gewogen: 80% mondeling examen en 20% WPO beoordeling (=praktijk examen). Als er minder dan een 8/20 voor het mondeling examen of praktijk examen wordt behaald, zal het eindtotaal maximaal 9/20 bedragen. Alleen voor het mondeling examen is een tweede zit mogelijk. Zowel voor het mondeling examen als voor het praktijk examen (de WPOs) wordt een deelvrijstelling gegeven bij een score van minstens 10/20. Deze vrijstelling geldt voor de tweede zit en het daaropvolgend academiejaar. Afstand van deelcijfers is niet mogelijk. 

Toegestane onvoldoende
Kijk in het aanvullend OER van je faculteit na of een toegestane onvoldoende mogelijk is voor dit opleidingsonderdeel.

Academische context

Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Bachelor in de biomedische wetenschappen: Standaard traject
Bachelor in de biomedische wetenschappen: Verkort traject