3 ECTS credits
90 u studietijd

Aanbieding 1 met studiegidsnummer 1017593BNR voor alle studenten in het 2e semester met een verdiepend bachelor niveau.

Semester
2e semester
Inschrijving onder examencontract
Niet mogelijk
Beoordelingsvoet
Beoordeling (0 tot 20)
2e zittijd mogelijk
Ja
Inschrijvingsvereisten
Students must have followed ‘Biochemistry’, before they can enroll for ‘Molecular Structure Function & Design’.
Onderwijstaal
Engels
Faculteit
Faculteit Wetenschappen en Bio-ingenieurswetensch.
Verantwoordelijke vakgroep
Bio-ingenieurswetenschappen
Onderwijsteam
Ruslan Efremov (titularis)
Onderdelen en contacturen
26 contacturen Hoorcollege
13 contacturen Werkvormen en Praktische Oef.
Inhoud

This course builds on the Biochemistry course of the 2nd bachelor and focuses on the intrinsic relation between the structure and the function of biological macromolecules and applications in design. The following topics are discussed in detail: 

•    Protein composition and structure (refreshing)

•    Catalytic strategies (refreshing)

•    Regulatory strategies (refreshing)

•    Membrane channels and pumps

•    Signal-transduction pathways

•    DNA replication, repair and recombination

•    Sensory system

•    Immune system

•    Molecular motors

•    Drug development

The course includes practicals on computers that teach students how to visualize and analyze protein structure using program pymol. Students choose a protein for which they perform structure analysis which they summarize in a written report and a short oral presentation. 

Studiemateriaal
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : Molecular Structure Function & Design, Slides
Handboek (Aanbevolen) : Biochemistry, Tymoczko and Stryer, 9de, Freeman, 9781319114657, 2019
Bijkomende info

-Slides and manuals deposited on the learning platform.

-Handboek: Biochemistry: Berg, Tymoczko and Stryer, 8the edition, Freeman

Leerresultaten

Algemene competenties

-In this course students learn about and get insight on some of the key aspects of modern molecular biology: the structure function relation of proteins and other complex macromolecules. We do this in the context of key physiological processes such as signal transduction, sensing, molecular movement, immune reactions, ...

-During the course, we teach the students that structural biology is an evolving sciences, meaning that many details are still unknown or uncertain.

- During practicals students will acquire practical skills in methods for visualizing and analyzing protein structure.

Beoordelingsinformatie

De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 100% van het eindcijfer

Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:

  • Mondeling Examen met een wegingsfactor 1 en aldus 100% van het totale eindcijfer.

    Toelichting: Mondeling examen, dat vooraggegaan wordt door een mondelinge voorbereiding

Aanvullende info mbt evaluatie

Evaluation has multiple components: 

25% of the grade is composed of assessment of the report and presentation of  practical work. 

Oral examination, preceded by a written preparation will include 3 questions (25% each)

First question will require student to assign protein sequence based on the 3D structure of a protein fragment  and describe its structural properties. 

Possible other two questions include:

•    Describe the difference between type 1 and type 2 topoisomerases

•    Describe the coordinated replication of DNA

Describe the molecular basis of antibody diversity

Toegestane onvoldoende
Kijk in het aanvullend OER van je faculteit na of een toegestane onvoldoende mogelijk is voor dit opleidingsonderdeel.

Academische context

Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Bachelor in de bio-ingenieurswetenschappen: profiel cel- en genbiotechnologie
Bachelor in de bio-ingenieurswetenschappen: Startplan