5 ECTS credits
150 u studietijd
Aanbieding 1 met studiegidsnummer 4016677ENR voor alle studenten in het 1e semester met een verdiepend master niveau.
Deze cursus behandelt een aantal theoretische concepten die betrekking hebben op de functionaliteit van eiwitten. Al deze concepten worden geïllustreerd aan de hand van voorbeelden.
In een eerste deel worden de eigenschappen die de 3-dimensionale structuur van eiwitten bepalen uitvoerig besproken. Hierbij wordt gestart van de chemische reactiviteit van de individuele aminozuren en de niet-covalente interacties die de 3-dimensionale structuur bepalen. Dit leidt tot een gedetailleerde beschrijving van secundaire structuren en tertiaire motieven die de vouwing van de hoofdketen bepalen, en de specifieke interacties van de zijketens die de fold coderen. Verdere aandacht gaat naar het belang van flexibiliteit in de functionaliteit van eiwitten met inbegrip van intrinsiek ontvouwen eiwitten.
In een tweede deel wordt dieper ingegaan op de stabiliteit en de vouwingsmechanismen van eiwitten. Hierin wordt zowel aandacht besteed aan de theoretische principes als aan de experimentele methoden.
In een laatste deel worden een aantal belangrijke functies van eiwitten besproken, o.a. ligandbinding en enzymkinetiek en –mechanismen.
Handouts bij de cursus worden beschikbaar gesteld via het leerplatform Canvas.
- De studenten kennen de chemische reactiviteit van aminozuren en kunnen deze interpreteren in de context van chemische modificaties van eiwitten
- De studenten kennen en begrijpen de niet-covalente interacties die bijdragen tot eiwitvouwing en ligand binding in een waterige omgeving
- De studenten hebben een grondige kennis van en inzicht in de structuur en functie van eiwitten. Ze kennen de verschillende (super)secundaire structuurelementen en weten welke parameters deze bepalen. Zij begrijpen hoe eiwitstructuur evolueert in functie van de aminozuursequentie
- De studenten kennen en begrijpen de fysicochemische principes die de eiwitstabiliteit en hun vouwing bepalen en kennen de experimentele methoden om deze te bepalen
- De studenten hebben een basiskennis van de principes en formules met betrekking tor enzymatische katalyse
- De studenten hebben kennis van en inzicht in de principes van ligandbinding en een aantal belangrijke methoden om ligandbinding te bestuderen
De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 100% van het eindcijfer
Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:
Mondeling examen met schriftelijke voorbereiding van een algemene open vraag die op meerdere delen van de cursus slaat en een aantal meer specifieke bijvragen.
Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: medische biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: moleculaire biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: cel- en genbiotechnologie: agrobiotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: voedingsbiotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: chemische biotechnologie
Master in de bio-ingenieurswetenschappen: chemie en bioprocestechnologie: biochemische biotechnologie