4 ECTS credits
100 u studietijd

Aanbieding 1 met studiegidsnummer 4023308DNR voor alle studenten in het 2e semester met een inleidend master niveau.

Semester
2e semester
Inschrijving onder examencontract
Niet mogelijk
Beoordelingsvoet
Beoordeling (0 tot 20)
2e zittijd mogelijk
Ja
Onderwijstaal
Engels
Faculteit
Faculteit Wetenschappen en Bio-ingenieurswetensch.
Verantwoordelijke vakgroep
Chemie
Onderwijsteam
Stefan Weckx (titularis)
Onderdelen en contacturen
13 contacturen Hoorcollege
13 contacturen Werkcolleges, practica en oefeningen
Inhoud

This course starts with an introduction to molecular biology and genetics, knowledge that is needed to understand the concepts and technologies discussed in this course. Next, second and third generation DNA sequencing methods will be discussed, including advantages and disadvantages and their mutual comparison. Hereafter, an introduction to bioinformatics will follow, together with an overview of the most current biological databases. Focus will be on searching those databases using text-based information. Subsequently, principles about DNA and protein sequence-based searches using sequence alignment programmes will be discussed. Next, focus will be on strategies in (meta)genomics and (meta)transcriptomics. Sequence data analysis will be performed hands-on using the scientific workflow platform Galaxy.

Studiemateriaal
Digitaal cursusmateriaal (Vereist) : PowerPoint slides will be made available
Bijkomende info

.

Leerresultaten

General competencies

The students are able to:

  • Discuss the principles of second and third generation sequencing methods;
  • Compare the sequencing methods, thereby indicating the strengths and weaknesses;
  • Discuss how second and third generation sequencing methods can be applied in (meta)genomics and (meta)transcriptomics;
  • Discuss which information is stored in the most common biological databanks;
  • Search and retrieve information from the most common biological databanks and platforms using text and sequence data;
  • Analyse sequence data using a scientific workflow platform.

Beoordelingsinformatie

De beoordeling bestaat uit volgende opdrachtcategorieën:
Examen Mondeling bepaalt 100% van het eindcijfer

Binnen de categorie Examen Mondeling dient men volgende opdrachten af te werken:

  • schriftelijke voorbereiding met een wegingsfactor 100 en aldus 100% van het totale eindcijfer.

Aanvullende info mbt evaluatie

The evaluation is based on an oral exam with written preparation

Toegestane onvoldoende
Kijk in het aanvullend OER van je faculteit na of een toegestane onvoldoende mogelijk is voor dit opleidingsonderdeel.

Academische context

Deze aanbieding maakt deel uit van de volgende studieplannen:
Master of Chemistry: Chemical Theory, (Bio)Molecular Design and Synthesis (enkel aangeboden in het Engels)